Η Υπηρεσία συστάθηκε σύμφωνα με την ΚΥΑ με Αριθμό 125888/1-3-2023 με τίτλο: «Διάρθρωση της Ειδικής Υπηρεσίας Συντονισμού και Διαχείρισης Προγραμμάτων Μετανάστευσης και Εσωτερικών Υποθέσεων και καθορισμός των τυπικών και ουσιαστικών προσόντων του προσωπικού που μετακινείται ή αποσπάται σε αυτήν, σύμφωνα με το άρθρο 76 του ν. 4375/2016», ΦΕΚ 2203Β/6-4-2023, όπως τροποποιήθηκε με την ΚΥΑ με αριθμ. πρωτ. 199773/2024 (ΦΕΚ Β 4415/29.07.2024). Σύμφωνα με την τελευταία:

«Άρθρο 1, Τροποποίηση του άρθρου 1
Στην παρ. 1 του άρθρου 1 της υπ’αρ. 125888/1-3-2023 (Β’ 2203) κοινής υπουργικής απόφασης προστίθεται εδάφιο ε. και ολόκληρη η παράγραφος διαμορφώνεται ως εξής:
«1. Η Ειδική Υπηρεσία Συντονισμού και Διαχείρισης Προγραμμάτων Μετανάστευσης και Εσωτερικών Υποθέσεων (Ε.Υ.ΣΥ.Δ.-Μ.Ε.Υ.) του Υπουργείου Μετανάστευσης και Ασύλου, έχει ως σκοπό την άσκηση των αρμοδιοτήτων που ορίζονται στο άρθρο 76 του ν.4375/2016, στο άρθρο 44 του ν. 4825/2021 και στην παρ. 1 του άρθρου 13 του ν. 4914/2022, λειτουργώντας ως:
α. Υπεύθυνη Αρχή για την περίοδο 2014-2020 για τη διαχείριση, την εφαρμογή και τον έλεγχο των εθνικών προγραμμάτων, σύμφωνα με τις διατάξεις των Κανονισμών (ΕΕ) 513/2014, 514/2014, 515/2014 και 516/2014 του Ευρωπαϊκού Κοινοβουλίου και του Συμβουλίου, των Ταμείων Ασύλου, Μετανάστευσης και Ένταξης και Εσωτερικής Ασφάλειας.

β. Διαχειριστική Αρχή, σύμφωνα με την παρ. 1 του άρθρου 71 του Κανονισμού (ΕΕ) 2021/1060 και συντονιστικός φορέας σύμφωνα με την παρ. 6 του ιδίου άρθρου, για τα προγράμματα των Ειδικών Κανονισμών (ΕΕ) 2021/1147, 2021/1148 και 2021/1149 (Ταμείο Ασύλου, Μετανάστευσης και Ένταξης, Μέσο για τη Χρηματοδοτική Στήριξη της Διαχείρισης των Συνόρων και την Πολιτική των Θεωρήσεων και Ταμείο Εσωτερικής Ασφάλειας κι εφεξής Ταμείων Μετανάστευσης και Εσωτερικών Υποθέσεων) για την Προγραμματική Περίοδο 2021-2027.
γ. Υπηρεσία Διαχείρισης για το Τομεακό Πρόγραμμα Ανάπτυξης του Εθνικού Προγράμματος Ανάπτυξης για το Υπουργείο Μετανάστευσης και Ασύλου για την περίοδο 2021-2025.
δ. Διαχειριστική Αρχή για προγράμματα άμεσης διαχείρισης των Ταμείων Ασύλου, Μετανάστευσης και Ένταξης και Εσωτερικής Ασφάλειας και του Μέσου για τη Χρηματοδοτική Στήριξη της Διαχείρισης των Συνόρων και την Πολιτική των Θεωρήσεων που της ανατίθενται με κοινή απόφαση των Υπουργών Μετανάστευσης και Ασύλου και Ανάπτυξης και Επενδύσεων.
ε. Ενδιάμεσος Φορέας (ΕΦ) για πράξεις του ΕΣΠΑ 2021-2027 που της ανατίθενται η διαχείριση με την έκδοση της
απόφασης της παρ. 4 του άρθρου 63 του ν. 4914/2022 για την εφαρμογή του άρθρου 13 του ως άνω νόμου.».

Άρθρο 2, Τροποποίηση του άρθρου 2
Η παρ. 1 του άρθρου 2 της υπ’αρ. 125888/1-3-2023 (Β’ 2203) κοινής υπουργικής απόφασης τροποποιείται και προστίθεται νέα Οργανική Μονάδα «Β.4: Διαχείρισης Πράξεων ΕΣΠΑ» και ολόκληρη η παρ. 1 διαμορφώνεται ως εξής:
«1. Η Ε.Υ.ΣΥ.Δ.-Μ.Ε.Υ. λειτουργεί σε επίπεδο Διεύθυνσης και διαρθρώνεται ως προς τις αρμοδιότητές της σε επτά (7) υπηρεσιακές Μονάδες σε επίπεδο Τμήματος ως εξής:
1. Μονάδα Α.1: Συντονισμού και Σχεδιασμού Προγραμμάτων
2. Μονάδα Α.2: Προγραμματισμού Δράσεων και Αξιολόγησης
3. Μονάδα Β.1: Διαχείρισης έργων/δράσεων ΤΕΑ και ΜΔΣΘ
4. Μονάδα Β.2: Διαχείρισης έργων/δράσεων ΤΑΜΕ και άλλων πόρων
5. Μονάδα Β.3: Διαχείρισης Ειδικών Δράσεων και δράσεων εμπλεκόμενων φορέων
5.α Μονάδα Β.4: Διαχείρισης Πράξεων ΕΣΠΑ
6. Μονάδα Γ: Οργάνωσης – Υποστήριξης και Υλοποίησης Δράσεων».
Η Υπηρεσία διαθέτει 55 εργαζόμενους.